Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms