Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2Q9UBS0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPS6KB2Q9UBS0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms