Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms