Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms