Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms