Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms