Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.275e-9■■■■■ 224
UTP3Q9NQZ2 DNHD1-220ENST00000534210 2867 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 223.8
UTP3Q9NQZ2 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.172e-8■■■■■ 223.8
UTP3Q9NQZ2 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.242e-8■■■■■ 223.8
UTP3Q9NQZ2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.12e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.482e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.382e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.356e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.252e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 KCTD5-203ENST00000564246 615 ntTSL 328.67■■■□□ 2.182e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GLG1-209ENST00000565260 461 ntTSL 528.6■■■□□ 2.178e-7■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PPM1K-205ENST00000509340 563 ntTSL 328.12■■■□□ 2.094e-26■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.78■■■□□ 2.042e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 OPN3-204ENST00000469376 1961 ntTSL 1 (best)27.65■■■□□ 2.022e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AC008105.3-205ENST00000590495 652 ntTSL 327.06■■□□□ 1.922e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.922e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 FANCA-228ENST00000567943 860 ntTSL 326.83■■□□□ 1.899e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.882e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 POU2F2-220ENST00000636631 591 ntTSL 526.63■■□□□ 1.852e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 JOSD1-204ENST00000427389 571 ntTSL 426.53■■□□□ 1.842e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.752e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 OPN3-205ENST00000478849 880 ntTSL 325.68■■□□□ 1.72e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TDP1-205ENST00000553527 910 ntTSL 325.25■■□□□ 1.632e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.632e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.622e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.612e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.582e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.572e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.564e-8■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 OPN3-206ENST00000490673 1816 ntTSL 1 (best)24.76■■□□□ 1.552e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SREBF1-208ENST00000469356 1323 ntTSL 324.55■■□□□ 1.522e-24■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SAP30BP-212ENST00000580322 1558 ntTSL 524.53■■□□□ 1.522e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TDP1-216ENST00000556867 748 ntTSL 224.37■■□□□ 1.492e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.462e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 UTP4-211ENST00000567460 595 ntTSL 424.13■■□□□ 1.452e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL4-216ENST00000533826 1037 ntTSL 324.01■■□□□ 1.438e-7■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.438e-7■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PUF60-222ENST00000533362 616 ntTSL 523.95■■□□□ 1.422e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ABHD12-204ENST00000461204 712 ntTSL 323.95■■□□□ 1.422e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TOR1AIP1-209ENST00000529091 587 ntTSL 423.88■■□□□ 1.412e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.392e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.392e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.399e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C19orf66-203ENST00000585919 2079 ntTSL 223.69■■□□□ 1.389e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.382e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RTKN-205ENST00000464094 1266 ntTSL 1 (best)23.65■■□□□ 1.382e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.372e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.322e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.312e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 E2F4-210ENST00000568485 707 ntTSL 223.25■■□□□ 1.316e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF180-203ENST00000585514 564 ntTSL 323.23■■□□□ 1.314e-8■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.32e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.38e-7■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 KLC3-203ENST00000494686 1194 ntTSL 1 (best)23.12■■□□□ 1.292e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.282e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 METTL16-208ENST00000576556 1944 ntTSL 223.05■■□□□ 1.282e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TRPS1-205ENST00000451156 569 ntTSL 423.04■■□□□ 1.284e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.262e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN5A-216ENST00000592679 923 ntTSL 222.92■■□□□ 1.262e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.252e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.242e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.222e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.222e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 KLC3-206ENST00000589837 973 ntTSL 522.68■■□□□ 1.222e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BIN2-208ENST00000605423 467 ntTSL 322.68■■□□□ 1.222e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SERPINB1-202ENST00000460260 580 ntTSL 222.65■■□□□ 1.229e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LIN54-208ENST00000509748 729 ntTSL 522.54■■□□□ 1.22e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.22e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 WHAMMP2-202ENST00000515318 1518 ntTSL 1 (best)22.47■■□□□ 1.192e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.199e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.172e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.152e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 POR-206ENST00000421059 631 ntTSL 422.2■■□□□ 1.142e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.142e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.132e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.122e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BIN2-201ENST00000452142 2115 ntTSL 221.97■■□□□ 1.112e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.12e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.19e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.12e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.098e-7■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 KLC3-205ENST00000589373 2006 ntTSL 521.8■■□□□ 1.082e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC4-209ENST00000487617 819 ntTSL 321.78■■□□□ 1.082e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 METTL16-207ENST00000574752 1602 ntTSL 521.77■■□□□ 1.082e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.069e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 APC2-206ENST00000590469 2316 ntTSL 1 (best)21.67■■□□□ 1.062e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.052e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.038e-7■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.022e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.012e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 12e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.992e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.992e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM39B-207ENST00000476968 1994 ntTSL 521.23■□□□□ 0.992e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 KLC3-207ENST00000590063 809 ntTSL 521.15■□□□□ 0.982e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.972e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.972e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.972e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.962e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.962e-9■■■■■ 223.6
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 632.3 ms