Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms