Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIT2Q9NQR4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIT2Q9NQR4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms