Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CLSPNQ9HAW4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms