Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms