Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms