Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM31Q9BZY9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms