Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF4Q9BZC1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms