Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC22CQ9BRL7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms