Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms