Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOL4Q9BPW4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOL4Q9BPW4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms