Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms