Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms