Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms