Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRUQ92729 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
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