Protein–RNA interactions for Protein: Q92673

SORL1, Sortilin-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORL1Q92673 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SORL1Q92673 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms