Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms