Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM136Q6ZRR5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms