Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM72Q6ZMU5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms