Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREML4Q6UXN2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms