Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms