Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC4Q6P2E9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms