Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms