Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms