Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms