Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A8Q2Y0W8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A8Q2Y0W8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms