Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.1 ms