Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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