Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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