Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK4Q16099 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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