Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms