Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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