Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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