Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
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