Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RAB33AQ14088 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RAB33AQ14088 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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RAB33AQ14088 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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