Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SHROOM2Q13796 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms