Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR4Q13639 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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