Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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