Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENBP1Q13228 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms