Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPA4Q13156 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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RPA4Q13156 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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RPA4Q13156 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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RPA4Q13156 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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