Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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