Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms