Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP1Q07960 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms