Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMX1Q04741 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms